অনেকগুলি ইউএসবি পেরিফেরালগুলিতে ফ্ল্যাশ-ভিত্তিক মাইক্রোকন্ট্রোলার অন্তর্ভুক্ত থাকে। যদিও মুখোশ-রোম-ভিত্তিক মাইক্রোকন্ট্রোলারগুলি সস্তা, একটি ফ্ল্যাশ-ভিত্তিক মাইক্রোকন্ট্রোলারের ব্যবহার একটি নির্মাতাকে এমন একটি বোর্ড রাখতে সক্ষম করতে পারে যা বিভিন্ন ইএম পণ্যগুলিতে যেতে পারে, যার প্রতিটি তার নাম বিক্রি করে যার নাম বিক্রি করে তা রিপোর্ট করে। কিছু পেরিফেরিয়ালগুলিতে ফার্মওয়্যার অন্তর্ভুক্ত থাকে যা তাদের ইউএসবি পোর্ট থেকে পুনরায় প্রোগ্রাম করার অনুমতি দেয়; তাদের সেভাবে কনফিগার করা কোনও নির্মাতাকে তার সর্বোচ্চ-আয়তনের গ্রাহকের উপযোগী উপায়ে প্রাক-প্রোগ্রাম অংশগুলির অনুমতি দেয় এবং অন্যান্য কাস্টমারদের চাহিদা অনুযায়ী পুনরায় প্রোগ্রাম করার অনুমতি দেয়।
যদি কোনও মাউস ফ্ল্যাশ মাইক্রোকন্ট্রোলার অন্তর্ভুক্ত করে, তবে কোনও দূষিত ব্যক্তির পক্ষে ম্যালওয়্যার-সংক্রমণ ডিভাইস হিসাবে আচরণ করার জন্য এটি পুনরায় প্রোগ্রাম করা সম্ভব হতে পারে। যেহেতু বেশিরভাগ ইঁদুরগুলি বিশেষত বড় মাইক্রোকন্ট্রোলার ব্যবহার করে না, তাই মাউসকে মাউস হিসাবে ব্যবহারের যোগ্য হওয়ার প্রয়োজন হলে ম্যালওয়্যারের জন্য কোনও জায়গা থাকতে পারে না। অন্যদিকে, কিছু ম্যালওয়্যারের পক্ষে একটি দুর্বল মাউস সনাক্তকরণ এবং এটিকে আবার প্রোগ্রাম করা সম্ভব হতে পারে যে এটি আর মাউস হিসাবে কাজ করবে না, তবে কোনও সংক্রামিত মেশিনে প্লাগ ইন করার সময় শয়তানের এজেন্ট হিসাবে কাজ করবে [তত্ত্ব অনুসারে যে যার মাউস কাজ বন্ধ করে সে অন্য কম্পিউটারে এটি পরীক্ষা করতে পারে]।
সাধারণত ইউএসবি পেরিফেরিয়ালটি এমনভাবে ডিজাইন করা কঠিন হবে না যে একবার চূড়ান্ত ফার্মওয়্যার লোড হয়ে গেলে এটি ইউএসবি পোর্ট থেকে পুনরায় লোড করা যায় না, তবে ডিভাইসগুলির মধ্যে পার্থক্য করার কোনও সাধারণ উপায় নেই যা ডিভাইসগুলি থেকে পুনরায় প্রোগ্রামিং থেকে সুরক্ষিত থাকে 'টি। একটি ডিসপ্লে এবং কিছু বোতামের সাহায্যে একটি "স্মার্ট ইউএসবি হাব" ডিজাইন করাও সম্ভব হবে যা যখন কোনও ডিভাইস প্লাগ ইন করা হয় তখন ডিভাইসটি কী দাবি করছে তা নির্দেশ করে, কম্পিউটারটি ডিভাইসটি দেখার আগে নিশ্চিতকরণের জন্য জিজ্ঞাসা করেছিল, এবং ডিভাইসের যোগাযোগগুলিকে তাদের ধরণের জন্য অনুমোদিত হয়েছিল এমনগুলিতে সীমাবদ্ধ করা হচ্ছে, তবে আমি জানি না যে এই জাতীয় কোনও স্মার্ট-হাব ডিভাইস উপলব্ধ কিনা।