পরে বিশ্লেষণ করার জন্য কি পিসিএ দ্বারা গৃহীত কোনও প্রয়োজনীয় পরিমাণের বৈকল্পিকতা রয়েছে?


15

আমার কাছে 11 টি ভেরিয়েবল সহ একটি ডেটাসেট রয়েছে এবং ডেটা হ্রাস করার জন্য পিসিএ (অर्थোগোনাল) করা হয়েছিল। বিষয়টি রাখার জন্য উপাদানগুলির সংখ্যা সম্পর্কে সিদ্ধান্ত নেওয়া আমার পক্ষে বিষয়টি সম্পর্কে আমার জ্ঞান এবং স্ক্রি প্লট (নীচে দেখুন) থেকে প্রমাণিত হয়েছিল যে দুটি মূল উপাদান (পিসি) তথ্য ব্যাখ্যা করার জন্য যথেষ্ট ছিল এবং বাকী উপাদানগুলি কেবলমাত্র কম তথ্যমূলক ছিল।

এখানে চিত্র বর্ণনা লিখুন
সমান্তরাল বিশ্লেষণ সহ স্ক্রি প্লট: পর্যবেক্ষণ করা ইগেনভ্যালু (সবুজ) এবং 100 টি সিমুলেশন (লাল) এর উপর ভিত্তি করে সিমুলেটেড ইজেনভ্যালুগুলি। স্ক্রি প্লট 3 টি পিসি প্রস্তাব দেয়, যেখানে সমান্তরাল পরীক্ষায় কেবল প্রথম দুটি পিসিই প্রস্তাব দেয়।

এখানে চিত্র বর্ণনা লিখুন

আপনি দেখতে পাচ্ছেন কেবল মাত্র 48% বৈকল্পিকতা দুটি প্রথম পিসি দ্বারা ক্যাপচার করা যেতে পারে।

প্রথম 2 পিসি দ্বারা তৈরি প্রথম বিমানটিতে পর্যবেক্ষণের মাধ্যমে হায়ারারিকালিকালগ্রিজাল ক্লাস্টারিং (এইচএসি) এবং কে-মানে ক্লাস্টারিং ব্যবহার করে তিনটি পৃথক ক্লাস্টার প্রকাশিত হয়েছিল। এই 3 টি ক্লাস্টার সমস্যার সমাধানের সাথে খুব প্রাসঙ্গিক বলে প্রমাণিত হয়েছিল এবং অন্যান্য অনুসন্ধানের সাথেও সামঞ্জস্য ছিল। সুতরাং কেবল মাত্র 48% বৈকল্পিকতা সমস্ত কিছু দুর্দান্তভাবে দখল করে নিয়েছিল except

আমার দুই পর্যালোচকদের মধ্যে একজন বলেছেন: একজন এই গবেষণাগুলির উপর খুব বেশি নির্ভর করতে পারে না কারণ কেবলমাত্র 48% বৈচিত্র্য ব্যাখ্যা করা যেতে পারে এবং এটি প্রয়োজনীয়তার চেয়ে কম।

প্রশ্নটি বৈধ হওয়ার জন্য পিসিএ দ্বারা কতটা বৈকল্পিক গ্রহণ করতে হবে
তার কোনও প্রয়োজনীয় মান আছে ? এটি ডোমেন জ্ঞান এবং ব্যবহারের পদ্ধতিগুলির উপর নির্ভর করে না? পুরো বিশ্লেষণের যোগ্যতাটি কি কেবল ব্যাখ্যাযোগ্য বৈকল্পিকের নিছক মূল্যের ভিত্তিতে বিচার করতে পারে?

মন্তব্য

  • ডেটা হ'ল জিনের 11 টি ভেরিয়েবল যা রিয়েল-টাইম কোয়ানটিটিভেটিভ পলিমেরেস চেইন রিঅ্যাকশন (আরটি-কিউপিসিআর) নামক আণবিক জীববিজ্ঞানের খুব সংবেদনশীল পদ্ধতি দ্বারা পরিমাপ করা হয়।
  • বিশ্লেষণগুলি আর ব্যবহার করে করা হয়েছিল।
  • মাইক্রোয়ারে বিশ্লেষণ, কেমোমেট্রিক্স, স্পেকোমেট্রিক বিশ্লেষণ বা এর মতো ক্ষেত্রে বাস্তব জীবনের সমস্যাগুলির উপর নির্ভর করে তাদের ব্যক্তিগত অভিজ্ঞতার উপর ভিত্তি করে ডেটা বিশ্লেষকদের উত্তরগুলি প্রশংসিত হয়।
  • যথাসম্ভব রেফারেন্স সহ উত্তরটি সমর্থন করার বিষয়টি বিবেচনা করুন।

ইগেনভ্যালুগুলির বিতরণ র্যান্ডম ম্যাট্রিক্স থিওরির পক্ষে বেশ গুরুত্বপূর্ণ। মারসেনকো-পাস্তুর বিতরণ কখনও কখনও অনুরূপ অ্যাপ্লিকেশনের জন্য ব্যবহৃত হয়।
জন

সবুজ কী এবং কমলা / বাদামী বর্ণগুলি কী দেখায়? অক্ষ আছে।
usεr11852 বলছেন

@ usεr11852, দয়া করে আপডেট করা ক্যাপশন দেখুন।
ডক্টরেট

উত্তর:


8

আপনার বিশেষ প্রশ্ন সম্পর্কে:

বৈধ হওয়ার জন্য পিসিএ দ্বারা কতটা বৈকল্পিক গ্রহণ করতে হবে তার কোনও প্রয়োজনীয় মান আছে?

না, নেই (আমার সেরা জ্ঞানের কাছে)। আমি দৃly়ভাবে বিশ্বাস করি যে আপনি ব্যবহার করতে পারেন এমন কোনও মান নেই; ক্যাপচারিত বৈকল্পিক শতাংশের কোনও যাদু প্রান্তিকতা নেই। কঙ্গেলোসি এবং গরিলির নিবন্ধ: সিডিএনএ মাইক্রোআরাই ডেটা প্রয়োগের ক্ষেত্রে মূল উপাদান বিশ্লেষণে উপাদান উপাদান ধরে রাখা একটি গবেষণায় উপাদানগুলির সংখ্যা সনাক্ত করতে থাম্বের অর্ধ ডজন স্ট্যান্ডার্ড নিয়মের একটি বরং সুন্দর পর্যালোচনা দেয় । (স্ক্রি প্লট, মোট বৈকল্পিকের অনুপাত ব্যাখ্যা করা হয়েছে, গড় ইগেনাল্যু বিধি, লগ-ইজেনভ্যালু ডায়াগ্রাম ইত্যাদি) থাম্বের নিয়ম হিসাবে আমি তাদের কোনওটির উপর দৃ strongly়ভাবে নির্ভর করব না not

এটি ডোমেন জ্ঞান এবং ব্যবহারের পদ্ধতিগুলির উপর নির্ভর করে না?

আদর্শভাবে এটি নির্ভরশীল হওয়া উচিত তবে আপনি কীভাবে এটি শব্দটি এবং কী বোঝাতে চাইছেন সে সম্পর্কে আপনার যত্নবান হওয়া উচিত।

উদাহরণস্বরূপ: অ্যাকোস্টিকসে জাস্ট নোটিবেবল ডিফারেন্স ( জেএনডি ) এর ধারণা রয়েছে । ধরে নিন আপনি একটি শাব্দিক নমুনা বিশ্লেষণ করছেন এবং একটি নির্দিষ্ট পিসির সেই জেএনডি প্রান্তিকের নীচে শারীরিক-স্কেল প্রকরণ রয়েছে। কেউ সহজেই তর্ক করতে পারে না যে অ্যাকোস্টিক অ্যাপ্লিকেশনটির জন্য আপনার সেই পিসি অন্তর্ভুক্ত করা উচিত ছিল। আপনি শ্রবণাতীত শব্দকে বিশ্লেষণ করবেন। এই পিসি অন্তর্ভুক্ত করার জন্য কিছু কারণ থাকতে পারে তবে এই কারণগুলি অন্য উপায়ে উপস্থাপন করা দরকার। তারা কি আরটি-কিউপিসিআর বিশ্লেষণের জন্য জেএনডি-র অনুরূপ?

একইভাবে, যদি কোনও উপাদান 9 ম অর্ডার লেজেন্ড্রে বহুত্বের মতো দেখায় এবং আপনার দৃ strong় প্রমাণ রয়েছে যে আপনার নমুনায় একক গাউসিয়ান বিম্ব রয়েছে, আপনার বিশ্বাস করার উপযুক্ত কারণ আছে যে আপনি আবার অপ্রাসঙ্গিক প্রকরণের মডেলিং করছেন। প্রকরণের এই অরথোগোনাল পদ্ধতিগুলি কী কী? উদাহরণস্বরূপ আপনার ক্ষেত্রে তৃতীয় পিসির সাথে "ভুল" কী?

আপনি " এই 3 টি ক্লাস্টারগুলি প্রশ্নের মধ্যে খুব প্রাসঙ্গিক হিসাবে প্রমাণিত হয়েছে " বলার বিষয়টি সত্যই দৃ strong় যুক্তি নয়। আপনি সহজ তথ্য ড্রেজ করতে পারেন (যা একটি খারাপ জিনিস)। অন্যান্য কৌশল আছে, যেমন। আইসোম্যাপস এবং স্থানীয়ভাবে লিনিয়ার এম্বেডিং , যা খুব দুর্দান্ত, কেন সেগুলি ব্যবহার করবেন না? কেন আপনি বিশেষভাবে পিসিএ বেছে নিয়েছিলেন?

অন্যান্য অনুসন্ধানগুলির সাথে আপনার অনুসন্ধানের ধারাবাহিকতা আরও গুরুত্বপূর্ণ, বিশেষত যদি এই অনুসন্ধানগুলি সু-প্রতিষ্ঠিত হিসাবে বিবেচিত হয়। এই উপর গভীর খনন। আপনার ফলাফলগুলি অন্যান্য গবেষণা থেকে পিসিএ অনুসন্ধানের সাথে একমত কিনা তা দেখার চেষ্টা করুন।

পুরো বিশ্লেষণের যোগ্যতাটি কি কেবল ব্যাখ্যাযোগ্য বৈকল্পিকের নিছক মূল্যের ভিত্তিতে বিচার করতে পারে?

সাধারণভাবে এটি করা উচিত নয়। আপনার পর্যালোচনা জারজ বা এ জাতীয় কিছু যদিও মনে করবেন না; ৪৮% আসলে যুক্তিসঙ্গত ন্যায়সঙ্গততা উপস্থাপন না করেই ধরে রাখতে পারার একটি ছোট শতাংশ।


আপনার উত্তর করার জন্য আপনাকে ধন্যবাদ। আরএনডি-তে আরটি-কিউপিআরসি-তে খুব একটা বিশেষ কিছু নেই। আসলে, আরটি-কিউপিসিআর হ'ল একমাত্র কৌশল যা আমরা জিনের ভেরিয়েবলগুলি নিজেরাই পরিমাপ করি। সম্ভবত আপনি পিসিগুলি বোঝাতে চেয়েছিলেন যা সমস্ত 11 এর রৈখিক সংমিশ্রণে তৈরি নতুন ভেরিয়েবলগুলি রয়েছে other অন্যথায় 3 য় পিসিতে কোনও ভুল নেই।
ডক্টরেট

আমি ডেটা ড্রেজ কৌশলগুলি এবং তাদের সম্পর্কে আরও শিখতে হবে। তবে আপনি কি সুযোগেই জানেন যে এটি কোনও আর-প্যাকেজ (গুলি) দ্বারা প্রয়োগ করা হয়েছে?
ডক্টরেট

1
@ ডক্টরেট: পুরো ধারণাটি হ'ল ডেটা ড্রেজিং এড়ানো। আমি দুঃখিত, কিন্তু আমি এমন কোনও প্যাকেজ জানি না যা এর জন্য স্পষ্টভাবে পরীক্ষা করে।
usεr11852 বলেছেন মনিক

1
+1, তবে ডেটা ড্রেজিং সম্পর্কে আপনার বাক্যটি ("আপনি সম্ভবত ডেটা ড্রেজ করতে পারেন") খুব পরিষ্কার নয় এবং সম্ভবত ডক্টরেট বিভ্রান্ত হয়েছিল। আসলে, আমি দেখতে পেয়েছি যে পুরো অনুচ্ছেদটি খুব পরিষ্কার নয়: আইসোম্যাপ এবং এলএলএর ডেটার ড্রেজিংয়ের সাথে কী সম্পর্ক আছে? ডেটা ড্রেজিং ভাল না খারাপ? আপনি যে উইকি নিবন্ধটির সাথে লিঙ্ক করেছেন তা এটিকে স্মেথ ভাল হিসাবে বর্ণনা দিয়ে শুরু করা হয়। সম্ভবত আপনি এই অনুচ্ছেদে কিছুটা আরও স্পষ্ট হতে সম্পাদনা করতে পারেন?
অ্যামিবা
আমাদের সাইট ব্যবহার করে, আপনি স্বীকার করেছেন যে আপনি আমাদের কুকি নীতি এবং গোপনীয়তা নীতিটি পড়েছেন এবং বুঝতে পেরেছেন ।
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.