প্রশ্ন : কিভাবে আমি পালন "পর্বত" -allele ফ্রিকোয়েন্সি (চিত্র -1) উল্লেখযোগ্যভাবে দক্ষিণ পাহাড়ে কেন্দ্রীয় কম চেয়ে পূর্বাভাস (চিত্র 2) পরিবেশগত নির্বাচন মডেল দ্বারা নির্ধারণ করতে একটি পরীক্ষা গঠন করা যেতে পারে ( বিস্তারিত জানার জন্য নিচে দেখুন )?
সমস্যা : আমার প্রাথমিক চিন্তাটি ছিল অক্ষাংশ: দ্রাঘিমাংশ এবং উচ্চতা (যা দ্রাঘিমাংশ এবং দ্রাঘিমাংশের মধ্যে কেবল ইন্টারঅ্যাকশনকে তাৎপর্যপূর্ণ হিসাবে চিহ্নিত করে) এর বিরুদ্ধে মডেল অবশিষ্টাংশগুলিকে পুনরায় চাপিয়ে দেবে। সমস্যাটি হ'ল অবশিষ্টাংশগুলি (চিত্র 3) মডেল দ্বারা ব্যাখ্যা না করা বিভিন্নতার প্রতিফলন করতে পারে এবং / বা এগুলি জৈবিক কিছু ঘটতে পারে, যেমন অ্যালিলের দক্ষিণে তার সম্ভাব্য দিকে ছড়িয়ে যাওয়ার সময় হয়নি বা জিন প্রবাহে কিছুটা বাধা রয়েছে। যদি আপনি পর্যবেক্ষণ করা (চিত্র 1) বনাম প্রত্যাশিত তুলনা করেন (চিত্র 2) পর্বত-অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সিগুলির মধ্যে একটি স্পষ্টত পার্থক্য রয়েছে বিশেষত সুইডেন এবং নরওয়ের মধ্য থেকে দক্ষিণ পর্বতগুলিতে। আমি স্বীকার করি যে মডেলটি সমস্ত প্রকারভেদ ব্যাখ্যা করতে পারে না, তবে আমি কি এই ধারণাটি অন্বেষণ করতে যুক্তিসঙ্গত পরীক্ষা দিয়ে আসতে পারি যে পাহাড়-অ্যালিলটি দক্ষিণের পাহাড়ের মধ্য থেকে সম্ভাব্য অবস্থানে পৌঁছেছে না?
পটভূমি: আমার একটি দ্বি-অ্যালালিক এএফএলপি চিহ্নিত আছে যার ফ্রিকোয়েন্সি বিতরণ স্ক্যান্ডিনেভিয়ান উপদ্বীপে (চিত্র 1) পর্বতমালার (এবং অক্ষাংশ: দ্রাঘিমাংশ) বনাম নিম্নভূমির বাসস্থানগুলির সাথে জড়িত বলে মনে হচ্ছে। "পর্বত" -লেলে উত্তরে প্রায় স্থির, যা পাহাড়ী। এটি প্রায় অনুপস্থিত বা দক্ষিণে "নিম্নভূমি" -এলেলে, যেখানে পাহাড়ের অভাব রয়েছে। পাহাড়ে উত্তর দিকে দক্ষিণে চলে যাওয়ার সাথে সাথে "পর্বত" -লেলে কম ফ্রিকোয়েন্সি হয়। উত্তর থেকে দক্ষিণে "পর্বত" -লেলে ফ্রিকোয়েন্সি মধ্যে এই পার্থক্যটি কেবল ফিলোজোগ্রাফি বা historicalতিহাসিক প্রক্রিয়াগুলির কারণে হতে পারে, কারণ অঞ্চলটি উত্তর এবং দক্ষিণ উভয় থেকেই colonপনিবেশিক ছিল। উদাহরণস্বরূপ, যদি পর্বত-অ্যালিলের উত্স উত্তর জনগোষ্ঠীতে হয় তবে সম্ভবত এটির দক্ষিণাঞ্চলে পুরোপুরি প্রসারণ করার সময় হয়নি has
আমার কার্যকারী হাইপোথিসিসটি হ'ল "পর্বত" -লেলে ফ্রিকোয়েন্সিটি বাস্তুসংস্থানীয় নির্বাচনের ফলাফল (নাল অনুমানটি নিরপেক্ষ নির্বাচন)।
আমার পরিবেশগত নির্বাচনের মডেলটির জন্য, আমি দ্বিপদী অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সি সহ জেনারালাইজড অ্যাডিটিভ মডেল (জিএএম) ব্যবহার করেছি রেসপন্স ভেরিয়েবল হিসাবে (129 সাইটগুলি ফেননস্ক্যান্ডিনেভিয়া জুড়ে নমুনাযুক্ত প্রতিটি সাইটে সাধারণত 10 থেকে 20 ব্যক্তি) এবং বিভিন্ন জলবায়ু এবং ক্রমবর্ধমান seasonতু পরিবর্তনশীল হিসাবে ভবিষ্যদ্বাণীকারী ভেরিয়েবল। মডেলের ফলাফলগুলি নিম্নরূপ (TMAX04-06 = এপ্রিল-জুন মাসে সর্বোচ্চ তাপমাত্রা, ফেন_এনপিপিএমএন = মানে ক্রমবর্ধমান seasonতু গাছপালা উত্পাদনশীলতা, পিইএইচএইচওয়াইআর = বার্ষিক সম্ভাব্য বাষ্পীভবন, ডিস্ট_কোস্ট = উপকূলের দূরত্ব):
Family: binomial
Link function: logit
Formula: Binomial_WW1 ~ s(TMAX_04) + s(TMAX_05) + s(TMAX_06) + s(Phen_NPPMN) +
s(PET_HE_YR) + s(Dist_Coast)
Parametric coefficients:
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept) -0.74372 0.04736 -15.7 <2e-16 ***
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
Approximate significance of smooth terms:
edf Ref.df Chi.sq p-value
s(TMAX_04) 3.8100 4.812 25.729 9.43e-05 ***
s(TMAX_05) 0.8601 1.000 5.887 0.01526 *
s(TMAX_06) 0.8862 1.000 7.644 0.00569 **
s(Phen_NPPMN) 6.2177 7.375 39.028 3.16e-06 ***
s(PET_HE_YR) 3.1882 4.147 18.039 0.00145 **
s(Dist_Coast) 2.2882 2.857 9.725 0.01906 *
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
R-sq.(adj) = 0.909 Deviance explained = 89.7%
REML score = 326.73 Scale est. = 1 n = 129
চিত্র 1. দ্বি-অ্যালালিক এএফএলপি চিহ্নিতকারীর জন্য "পর্বত" -লেলে ফ্রিকোয়েন্সি পর্যবেক্ষণ করা হয়েছে। কনট্যুর লাইনগুলি 0.1 ফ্রিকোয়েন্সি অন্তর, রঙ-শেডিং নিম্নতম এবং সর্বাধিক লাল জন্য ব্লুজগুলির সাথে উচ্চতা is
চিত্র 2. দ্বি-অ্যালালিক এএফএলপি চিহ্নিতকারীটির জন্য "মাউন্টেন" -লেলে ফ্রিকোয়েন্সি কনট্যুর লাইনগুলি 0.1 ফ্রিকোয়েন্সি অন্তর, রঙ-শেডিং নিম্নতম এবং সর্বাধিক লাল জন্য ব্লুজগুলির সাথে উচ্চতা is
চিত্র 3. ইকোলজিকাল সিলেকশন মডেল (জিএএম ব্যবহার করে) পুরো স্টাডি এরিয়া (ফেননস্ক্যান্ডিনেভিয়া) এবং নরওয়ে, সুইডেন এবং ফিনল্যান্ডের জন্য পৃথকভাবে ভেঙে গেছে res লাল ড্যাশযুক্ত রেখাগুলি উত্তর এবং দক্ষিণ জনসংখ্যার মধ্যে অন্যান্য এএফএলপি চিহ্নিতকারী এবং আফ্রিকায় তাদের পৃথক শীতকালীন জমিতে বেড়ে ওঠা পালকের স্থিতিশীল আইসোটোপ বিশ্লেষণের মধ্যে একটি মাধ্যমিক যোগাযোগ অঞ্চলকে প্রতিনিধিত্ব করে। পাতলা কালো বিন্দুযুক্ত রেখাটি জোনের কেন্দ্রস্থল।