আমি বুঝতে পারি যে কোনও জিন আবিষ্কার করার মতো জিনোমিক সিকোয়েন্সগুলিতে কীভাবে একটি লুকানো মার্কভ মডেল ব্যবহৃত হয়। তবে আমি বুঝতে পারি না যে কীভাবে কোনও নির্দিষ্ট মার্কভ মডেলটি উপস্থিত করা যায়। মানে, মডেলটির কতটি রাজ্য থাকা উচিত? সম্ভাব্য রূপান্তর কত? মডেলটির একটি লুপ থাকা উচিত?
তারা কীভাবে জানবে যে তাদের মডেলটি সর্বোত্তম?
তারা কি কল্পনা করে, 10 টি বিভিন্ন মডেল বলে, সেই 10 টি মডেলকে বেঞ্চমার্ক করে এবং সেরাটি প্রকাশ করে?
উত্তর:
আমি তিনটি প্রধান পদ্ধতির সাথে পরিচিত:
অবরোহী. আপনি হয়ত জানেন যে চারটি বেস জোড় থেকে বাছাই করতে পারে, এবং তাই এইচএমএমকে চারটি রাজ্য থাকতে দেয়। অথবা আপনি জানেন যে ইংরাজীর 44 টি ফোনমাস রয়েছে এবং ভয়েস রিকগনিশন মডেলটিতে লুকানো ফোনমে স্তরের জন্য 44 টি রাজ্য রয়েছে।
মুল্যায়ন। রাজ্যের সংখ্যা প্রায়শই আগেই অনুমান করা যায়, সম্ভবত এইচএমএমের পর্যবেক্ষণ করা বৈশিষ্ট্যগুলিতে সাধারণ ক্লাস্টারিং দ্বারা। যদি এইচএমএম ট্রানজিশন ম্যাট্রিক্স ত্রিভুজাকার হয় (যা প্রায়শই ব্যর্থতার পূর্বাভাসের ক্ষেত্রে হয়ে থাকে), রাষ্ট্রের সংখ্যা প্রারম্ভ অবস্থা থেকে শেষের রাজ্যে মোট সময়ের বন্টনের আকার নির্ধারণ করে।
অপ্টিমাইজেশান। আপনার পরামর্শ মতো, হয় অনেকগুলি মডেল তৈরি এবং ফিট হয় এবং সেরা মডেলটি নির্বাচিত হয়। কেউ এইচএমএম শিখতে পারে এমন পদ্ধতিটিও গ্রহণ করতে পারে যা প্রয়োজন অনুযায়ী মডেলগুলিকে যুক্ত বা বাতিল করতে দেয়।
আরও একটি পদ্ধতির মডেলগুলি থেকে অগণিত রাজ্যের অগণিত সংখ্যার নমুনা। 'কত'র উত্তর তারপরে স্যাম্পলারের উপর দিয়ে গড়ে উঠবে।