শূন্য-স্ফীত গামা মডেলগুলির যথাযথ ব্যবহার এবং ব্যাখ্যা


11

পটভূমি: আমি বর্তমানে বায়োস্ট্যাটিস্টিশিয়ান যিনি সেলুলার এক্সপ্রেশন হারের একটি ডেটাসেট নিয়ে কুস্তি করছি। গবেষণাটি বিভিন্ন দাতাদের কাছ থেকে কয়েকটি পেপটাইডে গোষ্ঠীতে সংগ্রহ করা প্রচুর কোষকে উদ্ভাসিত করেছিল । ঘরগুলি হয় প্রতিক্রিয়ার সাথে নির্দিষ্ট কিছু বায়োমার্কার প্রকাশ করে, বা তারা তা করে না। প্রতিক্রিয়া হারগুলি তখন প্রতিটি দাতা-গোষ্ঠীর জন্য রেকর্ড করা হয়। প্রতিক্রিয়া হার (শতাংশ হিসাবে প্রকাশিত) হ'ল আগ্রহের ফলাফল এবং পেপটাইড এক্সপোজারটি ভবিষ্যদ্বাণীকারী।

নোট করুন যে পর্যবেক্ষণগুলি দাতাদের মধ্যে ক্লাস্টার করা হয়।

যেহেতু আমার কাছে কেবল সংক্ষিপ্তসার ডেটা রয়েছে, তাই আমি দাতা-ভিত্তিক প্রতিক্রিয়া হারকে ক্রমাগত ডেটা হিসাবে বিবেচনা করছি (কমপক্ষে এখনকার জন্য)।

জটিলতাটি আমার ডেটাতে আমার অনেক শূন্য রয়েছে তা থেকে উদ্ভূত হয়। অনেক বেশি অবহেলিত। আমি জিরোগুলির অত্যধিক পরিমাণে একটানা ডেটা এবং স্ক্রু রেখেছি যে বিষয়টি মোকাবেলায় আমি শূন্য-স্ফীত গামা মডেলটি বিবেচনা করছি। আমি টোবিট মডেলটিও বিবেচনা করেছি, তবে এটি নিকৃষ্ট বলে মনে হচ্ছে যেহেতু এটি জেনুইন জিরো (ইকোনোমেট্রিকরা বলতে পারে যে পার্থক্যটি মোটা বলে বিপরীতে) এর বিপরীতে একটি নিম্ন সীমানায় সেন্সরিংয়ের কথা বলে।

প্রশ্ন: সাধারণভাবে বলতে গেলে, শূন্য-স্ফীত গামা মডেলটি ব্যবহার করা কখন উপযুক্ত? অর্থাৎ অনুমানগুলি কী? এবং কীভাবে এর ব্যাখ্যাগুলি ব্যাখ্যা করা যায়? আমি যদি কাগজপত্রে লিখিত লিঙ্কগুলির জন্য কৃতজ্ঞ হব, যদি আপনার কোনও থাকে।

আমি এসএএস-এল-তে একটি লিঙ্ক পেয়েছি যার মধ্যে ডেল ম্যাকলারান একটি শূন্য-স্ফীত গামা মডেলের জন্য এনএলএমআইএক্সইডি কোড সরবরাহ করে, তাই এটি সম্ভব বলে মনে হচ্ছে। তবুও, আমি অন্ধভাবে চার্জ করা ঘৃণা করব।

উত্তর:


5

প্রথমত, আপনি প্রকাশের ডেটাতে খাঁটি শূন্যগুলি দেখছেন না। আপনার জীববিজ্ঞানী বলছেন, সমস্ত জীববিজ্ঞানীর মতোই, তবে যখন কোনও জীববিজ্ঞানী "এটি শূন্য" এর অর্থ আসলে এটি "এটি আমার সনাক্তকরণের দোরের নিচে, সুতরাং এটির অস্তিত্ব নেই।" ক্ষেত্রটিতে গাণিতিক পরিশীলনের অভাবের কারণে এটি একটি ভাষার সমস্যা। আমি এখানে ব্যক্তিগত অভিজ্ঞতা থেকে কথা বলি।

আপনার সরবরাহিত লিঙ্কটিতে শূন্য স্ফীত গামার ব্যাখ্যাটি দুর্দান্ত। আপনার ডেটার দিকে পরিচালিত শারীরিক প্রক্রিয়াটি হ'ল, যদি আমি এটি বুঝতে পারি তবে একজন দাতা নির্বাচিত হয়, তারপরে একটি নির্দিষ্ট পেপটাইড দিয়ে চিকিত্সা করা হয় এবং প্রতিক্রিয়া সেই দাতার কোষ থেকে পরিমাপ করা হয়। এখানে বেশ কয়েকটি স্তর রয়েছে। একটি হ'ল দাতার প্রতিক্রিয়ার সামগ্রিক শক্তি, যা প্রতিটি নির্দিষ্ট কক্ষের পরিমাপের মত প্রকাশের স্তরে ফিড দেয়। যদি আপনি আপনার বার্নোল্লি ভেরিয়েবলকে শূন্য স্ফীত গামায় "দাতার প্রতিক্রিয়া পরিমাপ করার পক্ষে যথেষ্ট দৃ strong়" হিসাবে ব্যাখ্যা করেন তবে এটি ঠিক আছে। কেবলমাত্র নোট করুন যে সেক্ষেত্রে আপনি স্বতন্ত্র কক্ষের অভিব্যক্তির আওয়াজকে দৃ strongly়ভাবে সাড়া দেওয়ার জন্য দাতাদের মধ্যে পার্থক্যটি ঘটাচ্ছেন। যেহেতু একটি একক কক্ষে প্রকাশের শব্দে প্রায় গামা বিতরণ করা হয়,

যদি দাতা বনাম কোষগুলির অতিরিক্ত পরিবর্তনগুলি আপনার গামা ফিট করে না, এবং আপনি কেবল প্রয়োগিত পেপটাইড বনাম এক্সপ্রেশন পাওয়ার চেষ্টা করছেন, তবে এটি ঠিক না হওয়ার কোনও কারণ নেই।

যদি আরও বিশদ বিশ্লেষণের ক্রম হয়, তবে আমি আপনার পরিমাপের দিকে পরিচালিত প্রক্রিয়াটির সাথে মেলে একটি কাস্টম শ্রেণিবদ্ধ মডেল তৈরি করার পরামর্শ দেব।


3

আমি একটি সমাধান পেয়েছি যা আমি বরং মার্জিত বলে মনে করি। "শূন্যের সাথে ক্লাম্পিংয়ের সাথে পুনরাবৃত্ত পরিমাপের তথ্যের বিশ্লেষণ" শিরোনামে সাহিত্যে একটি দুর্দান্ত নিবন্ধ রয়েছে যা সম্পর্কিত সম্পর্কযুক্ত তথ্যের জন্য শূন্য-স্ফীত লগমনরমাল মডেলকে দেখায়। লেখকরা একটি এসএএস ম্যাক্রো সরবরাহ করে যা প্রোসি এনএলএমআইএক্সইডি ভিত্তিক এবং বাস্তবায়ন করা বেশ সহজ। সুসংবাদটি হ'ল repeatedএটি ম্যাক্রোর বিবৃতি বাদ দিয়ে ক্লাস্টার্ড পর্যবেক্ষণ ছাড়াই কেসগুলিকে সহজ করতে পারে । খারাপ খবরটি হ'ল এনএলএমএক্সএডের এখনও অনেকগুলি পরস্পর সম্পর্কিত কাঠামো নেই যা আমাদের প্রায়শই প্রয়োজন, যেমন অটোরিগ্রেসিভ।

ম্যাক্রোর নামকরণ করা হয়েছে MIXCORR, এবং এটির একটি খুব দরকারী উইকি পৃষ্ঠা রয়েছে যা আপনি এখানে খুঁজে পেতে পারেন । ম্যাক্রো নিজেই এখানে ডাউনলোড করা যায়

আমি এই লিঙ্কগুলির সমস্ত প্রস্তাব করছি। আশা করি আপনি সেগুলি কার্যকর হবেন।

আমাদের সাইট ব্যবহার করে, আপনি স্বীকার করেছেন যে আপনি আমাদের কুকি নীতি এবং গোপনীয়তা নীতিটি পড়েছেন এবং বুঝতে পেরেছেন ।
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.