শূন্য-স্ফীতিত ডেটা সহ গ্যাম


9

আর-তে শূন্য-স্ফীতিত ডেটার জন্য কোনও জিএএমএম (জেনারেলাইজড অ্যাডিটিভ মিক্সড মডেল) ফিট করা কি সম্ভব?

যদি তা না হয়, তবে আর-তে নেতিবাচক দ্বিপদী বা অর্ধেক পয়েসন বিতরণের সাথে শূন্য-স্ফীতিত ডেটার জন্য কোনও জিএএম (জেনারেলাইজড অ্যাডিটিভ মডেল) ফিট করা সম্ভব? (আমি কোজিগাম :: জিগাম এবং এমজিসিভি: পইসন বিতরণের জন্য জিআইপি ফাংশন পেয়েছি )

উত্তর:


8

ছাড়াও mgcv এবং তার শূন্য স্ফীত পইসন পরিবার ( ziP()এবং ziplss()), তবে আপনাকে তাকান পারে brms পল খৃস্টান Bürkner দ্বারা প্যাকেজ। এটি বিতরণ মডেলগুলিতে ফিট করতে পারে (যেখানে আপনি কেবল গড়ের চেয়ে বেশি মডেল করেন, আপনার ক্ষেত্রে মডেলের শূন্য-মুদ্রাস্ফীতি উপাদানকে কাউন্ট ফাংশনের মতো কোভারিয়েটের একটি ফাংশন হিসাবে মডেল করা যেতে পারে)।

আপনি লিনিয়ার প্রেডিক্টরের কোনওটিতে স্মিথগুলি অন্তর্ভুক্ত করতে পারেন (গড় / গণনা, শূন্য-মুদ্রাস্ফীতি অংশ ইত্যাদি) এর মাধ্যমে s()এবং t2()শর্তাবলী যথাক্রমে সাধারণ 1-ডি বা আইসোট্রপিক 2-ডি স্প্লাইনস বা অ্যানিসোট্রপিক টেনসারের পণ্য স্প্লাইজের জন্য। এটিতে শূন্য-স্ফীত দ্বিপদী, পইসন, নেতিবাচক দ্বিপদী এবং বিটা বিতরণ, এবং শূন্য-এক-স্ফীত বিটা বিতরণের সমর্থন রয়েছে। এটিতে পয়সন এবং নেতিবাচক দ্বিপদী প্রতিক্রিয়াগুলির জন্যও বাধা মডেল রয়েছে (যেখানে মডেলটির গণনা অংশটি একটি কাটা বিতরণ হয় যাতে আরও শূন্যের সংখ্যা না উত্পাদন করা যায়)।

brms এই মডেলগুলিকে স্ট্যান ব্যবহার করে ফিট করে , সুতরাং এগুলি পুরোপুরি বায়েশিয়ান, তবে এর জন্য আপনাকে প্রাসঙ্গিক তথ্য আহরণের জন্য নতুন সেট ইন্টারফেস শিখতে হবে। এটি বলেছিল, কেবলমাত্র এই টাস্কের জন্য বেশ কয়েকটি প্যাকেজ সমর্থন ফাংশন সরবরাহ করে, এবং brmsসহায়িকা ফাংশন রয়েছে যা এই গৌণ প্যাকেজগুলি ব্যবহার করে। আপনাকে স্ট্যান ইনস্টল করতে হবে এবং আপনাকে সি -++ সংকলক লাগবে কারণ বিমৃতকরণ বিবর্তনের জন্য স্ট্যান কোডটিতে আর ব্যবহার করে সংজ্ঞায়িত মডেলটি সংকলন করে।


4

glmmTMBপ্যাকেজ এই প্রস্তাব এবং একটি সাম্প্রতিক bioRxiv কাগজ বর্ণনা করা হয়: ব্রুকস এট অল। (2017)। মডেলিং শূন্য-স্ফীত গণনা ডেটাglmmTMB , বায়োআরক্সিভ, ডোই: 10.1101 / 132753 এর সাথে

গ্যাভিন সিম্পসনের একটি দুর্দান্ত ব্লগ পোস্টও রয়েছে যা এই উদ্দেশ্যেটির glmmTMBসাথে তুলনা করে mgcv: ফিটিং গণনা এবং শূন্য-স্ফীত গণনা জিএলএমএমজি এমজিসিভি সহ


1
+1 আমার ব্লগ পোস্টে লিঙ্কের জন্য ধন্যবাদ। এটি মজাদার ছিল, দুপুরে বিভ্রান্তকারী নতুন পিকেজি নিয়ে খেলছিল।
গ্যাভিন সিম্পসন

brmsসত্যিই খুব সুন্দর এবং নমনীয় যা নির্দেশ করার জন্য ধন্যবাদ । নিক আরও উলামাফের সাথে একসাথে bamlssআরও কিছু নমনীয় রিগ্রেশন বৈশিষ্ট্য পাওয়ার জন্য আমি কয়েকটি গণনা পরিবার লেখার পরিকল্পনা করছি ... তবে এখনও পর্যন্ত আমরা ডেটা বিতরণ গণনা করতে গোল পাই নি।
আছিম জিলিইস
আমাদের সাইট ব্যবহার করে, আপনি স্বীকার করেছেন যে আপনি আমাদের কুকি নীতি এবং গোপনীয়তা নীতিটি পড়েছেন এবং বুঝতে পেরেছেন ।
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.