আনোভা ত্রি-মুখী পুনরাবৃত্তি ব্যবস্থাগুলির জন্য একটি বৈধ পোস্ট-হক বিশ্লেষণ কী?


10

আমি তিন ধরণের পুনরাবৃত্তি ব্যবস্থা আনোভা সম্পাদন করেছি; কোন উত্তর-বিশ্লেষণ বৈধ?

এটি একটি সম্পূর্ণ ভারসাম্যযুক্ত নকশা (2x2x2) এর মধ্যে অন্যতম কারণগুলির মধ্যে বারবার পরিমাপের একটি কারণ রয়েছে। আমি আর-তে বারবার ব্যবস্থা আনোভা সম্পর্কিত বহুবিধ পদ্ধতির বিষয়ে সচেতন, তবে আমার প্রথম প্রবৃত্তিটি আনোভা-র একটি সহজ অ্যাওভ () স্টাইলের সাথে এগিয়ে যাওয়া:

aov.repeated <- aov(DV ~ IV1 * IV2 * Time + Error(Subject/Time), data=data)

ডিভি = প্রতিক্রিয়া পরিবর্তনশীল

আইভি 1 = স্বতন্ত্র ভেরিয়েবল 1 (2 স্তর, A বা B)

আইভি 2 = স্বতন্ত্র ভেরিয়েবল 2 (2 স্তর, হ্যাঁ বা না)

আইভি 3 = সময় (2 স্তর, আগে বা পরে)

বিষয় = সাবজেক্ট আইডি (40 মোট বিষয়, আইভি 1 এর প্রতিটি স্তরের 20 টি: এনএ = 20, এনবি = 20)

summary(aov.repeated)

    Error: Subject
          Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)   
IV1       1   5969  5968.5  4.1302 0.049553 * 
IV2       1   3445  3445.3  2.3842 0.131318   
IV1:IV2   1  11400 11400.3  7.8890 0.007987 **
Residuals 36  52023  1445.1                    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Error: Subject:Time
               Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)   
Time            1    149   148.5  0.1489 0.701906   
IV1:Time        1    865   864.6  0.8666 0.358103   
IV2:Time        1  10013 10012.8 10.0357 0.003125 **
IV1:IV2:Time    1    852   851.5  0.8535 0.361728   
Residuals      36  35918   997.7                    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

বিকল্পভাবে, আমি একটি lme স্টাইল আনোভা জন্য nlme প্যাকেজটি ব্যবহার করার কথা ভাবছিলাম:

aov.repeated2 <- lme(DV ~ IV1 * IV2 * Time, random = ~1|Subject/Time, data=data)
summary(aov.repeated2)

Fixed effects: DV ~ IV1 * IV2 * Time 
                                Value Std.Error DF   t-value p-value
(Intercept)                      99.2  11.05173 36  8.975972  0.0000
IV1                              19.7  15.62950 36  1.260437  0.2156
IV2                              65.9  15.62950 36  4.216385  0.0002 ***
Time                             38.2  14.12603 36  2.704228  0.0104 *
IV1:IV2                         -60.8  22.10346 36 -2.750701  0.0092 **
IV1:Time                        -26.2  19.97722 36 -1.311494  0.1980
IV2:Time                        -57.8  19.97722 36 -2.893295  0.0064 **
IV1:IV2:Time                     26.1  28.25206 36  0.923826  0.3617

মাল্টিকম্প প্যাকেজ থেকে গ্লাহ্ট () ব্যবহার করে টুকির সাথে তাত্পর্যপূর্ণ গুরুত্বপূর্ণ 2-মুখোমুখি ইন্টারঅ্যাক্টের প্রথম প্রবৃত্তি আমার সাথে সম্পর্কিত:

data$IV1IV2int <- interaction(data$IV1, data$IV2)
data$IV2Timeint <- interaction(data$IV2, data$Time)

aov.IV1IV2int <- lme(DV ~ IV1IV2int, random = ~1|Subject/Time, data=data)
aov.IV2Timeint <- lme(DV ~ IV2Timeint, random = ~1|Subject/Time, data=data)

IV1IV2int.posthoc <- summary(glht(aov.IV1IV2int, linfct = mcp(IV1IV2int = "Tukey")))
IV2Timeint.posthoc <- summary(glht(aov.IV2Timeint, linfct = mcp(IV2Timeint = "Tukey")))

IV1IV2int.posthoc
#A.Yes - B.Yes == 0        0.94684   
#B.No - B.Yes == 0         0.01095 * 
#A.No - B.Yes == 0         0.98587    I don't care about this
#B.No - A.Yes == 0         0.05574 .  I don't care about this
#A.No - A.Yes == 0         0.80785   
#A.No - B.No == 0          0.00346 **

IV2Timeint.posthoc 
#No.After - Yes.After == 0           0.0142 *
#Yes.Before - Yes.After == 0         0.0558 .
#No.Before - Yes.After == 0          0.5358   I don't care about this
#Yes.Before - No.After == 0          0.8144   I don't care about this
#No.Before - No.After == 0           0.1941  
#No.Before - Yes.Before == 0         0.8616

এই পোস্ট-হক বিশ্লেষণগুলির সাথে আমি যে প্রধান সমস্যাটি দেখি তা হ'ল কিছু তুলনা যা আমার অনুমানের জন্য কার্যকর নয়।

যথাযথ পোস্ট-বিশ্লেষণের জন্য কোনও পরামর্শ প্রশংসিত হয়, ধন্যবাদ।

সম্পাদনা করুন: প্রাসঙ্গিক প্রশ্নোত্তর যা ম্যানুয়াল বিপরীতে ম্যাট্রিক পরীক্ষা করার দিকে নির্দেশ করে


তোমার র্যান্ডম প্রতিক্রিয়া মডেল অদ্ভুত দেখায়: /(যেমন সাধারণত একটি বিভক্ত-চক্রান্ত পরীক্ষা দেখা) এর ব্যবহার অসদৃশ বোঝাতে পাখির করতে ব্যবহৃত হয়, Errorমেয়াদের aov()যেখানে এটি প্রধানত কিভাবে বিল্ড ইঙ্গিত ত্রুটি স্তরে
chl

@chl আমি ফরম্যাট Errorমেয়াদের aov()যে নির্দিষ্ট করার এই ভাবে Timeমধ্যে-গ্রুপ ফ্যাক্টর। ব্যারন থেকে Error(subj/(color + shape))মনে হয় একইভাবে ব্যবহার করা হচ্ছে।
রবজ্যাকসন 28

@ সিএইচএল, lmeমডেলটি সামনে আনার জন্য আপনাকে ধন্যবাদ , আমি এর সঠিক ব্যবহার সম্পর্কে অস্পষ্ট /। আপনি কিভাবে নির্দিষ্ট হবে Timeহিসাবে মধ্যে-গ্রুপ ফ্যাক্টর হিসেবে Error()সঙ্গে aov()?
রবজ্যাকসন 28

উত্তর:


2

আমি মনে করি পরিসংখ্যানবিদরা আপনাকে বলবেন যে কোনও পোস্ট পোস্ট বিশ্লেষণে সর্বদা সমস্যা থাকে কারণ ডেটা দেখে আপনি যা দেখেন তার উপর প্রভাব ফেলতে পারে এবং আপনি উল্লেখযোগ্য ফলাফলের জন্য শিকার করছেন এমন কারণে আপনি পক্ষপাতদুষ্ট হতে পারেন। ক্লিনিকাল ট্রায়াল স্টাডিতে এফডিএর প্রয়োজন প্রোটোকলটিতে পরিসংখ্যান পরিকল্পনা সম্পূর্ণরূপে বানান করা উচিত। একটি রৈখিক মডেলটিতে আপনি অবশ্যই আনোভা বা আনকোভা সামগ্রিক পার্থক্য খুঁজে পান এমন ইভেন্টে আপনি দেখতে চান সেই বৈসাদৃশ্যগুলির পূর্বনির্ধারিত করতে পারেন। এই ধরণের পূর্বনির্ধারিত বৈপরীত্যগুলি ততক্ষণ দেখার পক্ষে ঠিক হবে যতক্ষণ পর্যন্ত বহুগুণের জন্য চিকিত্সা এটির একটি অংশ।


বিশ্লেষণটি আমার কাছে হস্তান্তরিত হবার পরে আমার যে সমস্যাটি হচ্ছে তা হ'ল ( "আসুন একচেটিয়া টি-টেস্ট চালাও" ব্যতীত কোনও প্রাক্কলনিক পরিসংখ্যান পরিকল্পনা ছাড়া)। আমি মূলত উদ্দিষ্ট প্রাথমিক অনুমানগুলি নিষ্ক্রিয় করতে সক্ষম হয়েছি, তবে পোস্ট-বাক্স সিনট্যাক্স নিয়ে আমার একটু সমস্যা হচ্ছে। পরীক্ষককে এই সমস্ত পদক্ষেপের ন্যায়সঙ্গত করা আমার মূল লক্ষ্য, যাতে টি-পরীক্ষা ডগমা এড়ানোর জন্য। চূড়ান্ত লক্ষ্য: ভবিষ্যতের পরীক্ষামূলক ডিজাইনের জন্য পরিসংখ্যানিক পরিকল্পনাকে একটি প্রয়োজনীয়তা তৈরি করুন। আপাতত, আমার যা আছে তা নিয়ে কাজ করতে পেরেছি।
রবজ্যাকসন 28

1
তারপরে আমি কেবল যুক্ত করব যে আপনি যদি পোস্ট-হক বিশ্লেষণগুলি নিয়ে এগিয়ে যেতে চান, আপনি যতক্ষণ না সঠিক গুণগত মান সমন্বয় করেন ততক্ষণ আমি কোনও সমস্যা দেখছি না।
মাইকেল আর। চেরনিক

1
আমি কী ধরে নিচ্ছি যে মাল্টিসিপলসিটি সামঞ্জস্য পরিবার-ভিত্তিক ত্রুটি সামঞ্জস্যের সাথে সাদৃশ্যপূর্ণ? যেমন, টুকি, বনফেরোনি ইত্যাদি?
রবজ্যাকসন 28

ঠিক তাই. বুটস্ট্র্যাপ এবং সারমিটেশন পদ্ধতিগুলি এসএএসে উদাহরণস্বরূপ প্রোক মাল্টটিস্টের সাথে উপলব্ধ। ওয়েস্টফল এবং ইয়ংয়ের কাজ দেখুন।
মাইকেল আর চেরনিক

@ মিশেল সহায়তার জন্য আপনাকে ধন্যবাদ, আমি এটি প্রশংসা করি। যাইহোক, আমি এখনও ব্যবহার করতে সিনট্যাক্স সম্পর্কে অস্পষ্ট R। বিশেষত, আমি নিশ্চিত নই যে প্রাসঙ্গিক টুকি ব্যবহার করে বৈসাদৃশ্য ব্যবহারের জন্য ম্যানুয়ালি ম্যানুয়ালি নির্দিষ্ট করা glht()বা ডিফল্টরূপে সমস্ত তুলনা সম্পাদন করা সবচেয়ে উপযুক্ত । তদতিরিক্ত, Timeপোস্ট-হক এর ক্ষেত্রে পুনরাবৃত্তি পরিমাপের সাথে কীভাবে সঠিকভাবে মোকাবেলা করতে হবে তা সম্পর্কে আমি নিশ্চিত নই ।
রবজ্যাকসন 28

1

আপনার কাছে যদি এসএএসের মতো একটি সফ্টওয়্যার প্যাকেজ থাকে তবে আপনি সম্ভবত বারবার ব্যবস্থাগুলি মিশ্রিত মডেলটি করতে প্র্যাক মিক্সড ব্যবহার করবেন এবং যদি আপনি কোন বিপরীতে এসএএস ব্যবহার করতে চান তা আপনার পক্ষে এটি সঠিকভাবে পরিচালনা করবে। আপনি প্রোসি জিএলএম-এ পুনরাবৃত্তি বিকল্পের সাহায্যে এটি করতে সক্ষম হতে পারেন তবে সাবধান হন কারণ তারা অন্যরকম আচরণ করে এবং বিভিন্ন ধারণা তৈরি করে। পুনরাবৃত্তি পর্যবেক্ষণগুলি সাধারণত সংশোধন করা হয় কারণ তাদের কিছু সাধারণ রয়েছে। আমি প্রায়শই বিভিন্ন সময় পয়েন্টে একই রোগীর উপর বারবার ব্যবস্থা গ্রহণ করি। সুতরাং গণনা করার ক্ষেত্রে বৈপরীত্য সংক্রান্ত শর্তাদি সমস্যার মধ্যে প্রবেশ করে।

আমাদের সাইট ব্যবহার করে, আপনি স্বীকার করেছেন যে আপনি আমাদের কুকি নীতি এবং গোপনীয়তা নীতিটি পড়েছেন এবং বুঝতে পেরেছেন ।
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.