প্রশ্ন ট্যাগ «r»

/ সম্পাদনা: আরও অনুসরণ করুন এখন আপনি irlba :: prcomp_irlba ব্যবহার করতে পারেন / সম্পাদনা: আমার নিজের পোস্টে অনুসরণ করা। irlbaএখন "কেন্দ্র" এবং "স্কেল" আর্গুমেন্ট রয়েছে, যা আপনাকে নীতি উপাদানগুলি গণনা করতে এটি ব্যবহার করতে দেয়, যেমন: pc <- M %*% irlba(M, nv=5, nu=0, center=colMeans(M), right_only=TRUE)$v আমার কাছে একটি Matrixমেশিন …

31 r  pca  dimensionality-reduction  svd  matrix-decomposition 

প্রিন্সিপাল কম্পোনেন্ট বিশ্লেষণের আউটপুটটি কীভাবে উপস্থাপন করা সম্ভব যে কেবল সংক্ষিপ্তসার সারণির চেয়ে আরও অন্তর্দৃষ্টি দেয়? Ob 1e4 বলুন, পর্যবেক্ষণের সংখ্যা বড় হলে এটি করা কি সম্ভব? এবং এটি কি আর [অন্যান্য পরিবেশের স্বাগত] তে করা সম্ভব?

31 r  data-visualization  pca  biplot 

ট্রেভর হাস্টি এবং রবার্ট তিবশিরানী এবং জেরোম ফ্রেডম্যানের এলিমেস্ট্যাটলার্ন "স্ট্যাটাসটিকাল লার্নিং এর উপাদানসমূহ: ডেটা মাইনিং, ইনফারেন্সেশন এবং প্রিডিকেশন। দ্বিতীয় সংস্করণ" বইয়ে বর্ণিত প্লটটি আমি উত্পন্ন করতে চাই। প্লটটি হ'ল: আমি ভাবছি যে আমি কীভাবে এই সঠিক গ্রাফটি উত্পাদন করতে পারি R, বিশেষ করে গ্রিড গ্রাফিক্স এবং সীমানাটি দেখানোর জন্য গণনা …

31 r  data-visualization  k-nearest-neighbour 

আমি কিছু বিতরণ পেয়েছি যার জন্য BUGS এবং R এর বিভিন্ন প্যারামিটারাইজেশন রয়েছে: সাধারণ, লগ-নরমাল এবং ওয়েবুল। এর প্রত্যেকটির জন্য, আমি সংগ্রহ করি যে আর ইউ দ্বারা ব্যবহৃত দ্বিতীয় প্যারামিটারটি বিইউজিএস (বা আমার ক্ষেত্রে জেজিএস) ব্যবহার করার আগে বিপরীত রূপান্তরকরণ (1 / পরামিতি) হওয়া দরকার। বর্তমানে বিদ্যমান এই রূপান্তরগুলির একটি …

31 r  distributions  bugs  jags  parameterization 

আমি একটি মিশ্র প্রভাব মডেল ব্যবহার করে কিছু তথ্য বিশ্লেষণ করার চেষ্টা করছি। আমি যে তথ্য সংগ্রহ করেছি তা সময়ের সাথে সাথে বিভিন্ন জিনোটাইপের কিছু তরুণ প্রাণীর ওজন উপস্থাপন করে। আমি এখানে প্রস্তাবিত পদ্ধতির ব্যবহার করছি: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repected-measures-anova-used-r/ বিশেষত আমি সমাধান # 2 ব্যবহার করছি সুতরাং আমি কিছু আছে require(nlme) model …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

প্রসঙ্গ: প্রজননযোগ্য গবেষণা সম্পর্কে জ্যাক লিখেছেন সম্পর্কে আগের প্রশ্নের জবাবে আমাদের জাসা সংরক্ষণাগারটি তৈরি করার সময় আমরা যে সমস্যাটি আবিষ্কার করেছি তা হ'ল সিআরএন প্যাকেজগুলির সংস্করণ এবং ডিফল্ট পরিবর্তন হয়েছিল। সুতরাং, সেই সংরক্ষণাগারে, আমরা যে প্যাকেজগুলি ব্যবহার করি সেগুলির সংস্করণগুলিও অন্তর্ভুক্ত করি। লোকেরা তাদের প্যাকেজ পরিবর্তন করার সাথে সাথে সম্ভবত …

31 r  reproducible-research  project-management 

আমি একটি দিকে ভেরিয়েবল সেট আপেক্ষিক গুরুত্ব নির্ধারণ করতে চাই randomForestআর এ শ্রেণীবিন্যাস মডেল importanceফাংশন প্রদান করে MeanDecreaseGiniপ্রতিটি predictor জন্য মেট্রিক - এটা একটি সেট প্রতিটি predictor জুড়ে এই summing হিসাবে সহজ হিসাবে? উদাহরণ স্বরূপ: # Assumes df has variables a1, a2, b1, b2, and outcome rf <- randomForest(outcome ~ …

31 r  machine-learning  classification  random-forest 

লাসো রিগ্রেশন মডেল এবং অন্যান্য নিয়মিত মডেল যেখানে প্যারামিটারগুলি কেবল আংশিকভাবে সমীকরণে প্রবেশ করছে সেখানে এআইসি বা বিআইসির মান গণনা করা সম্ভব? একজন কীভাবে স্বাধীনতার ডিগ্রি নির্ধারণ করে? আমি প্যাকেজ glmnet()থেকে ফাংশনটির সাথে লাসো রিগ্রেশন মডেলগুলি ফিট করার জন্য আর ব্যবহার করছি glmnetএবং আমি কীভাবে কোনও মডেলের জন্য এআইসি এবং …

31 r  model-selection  lasso  aic  bic 

আমি লক্ষ করি যে লক্ষ লক্ষ পয়েন্ট উপস্থিত থাকলে প্লটগুলি তৈরি করতে দীর্ঘ সময় নিতে পারে - পয়েন্টগুলি পৃথকভাবে প্লট করা হয়েছে তা অবাক করে না ing তদুপরি, এই জাতীয় প্লটগুলি প্রায়শই খুব বিশৃঙ্খলাযুক্ত এবং দরকারী হয়ে ওঠে are পয়েন্টগুলির মধ্যে অনেকগুলি ওভারল্যাপ হয়ে একটি কালো ভর তৈরি করে এবং …

31 r  data-visualization 

আমি আশা করছি যে কোনওটি কোয়াসিবিনোমিয়াল বিতরণ কী এবং এটি কী করে তার একটি স্বজ্ঞাত ওভারভিউ সরবরাহ করতে পারে। আমি এই বিষয়গুলিতে বিশেষভাবে আগ্রহী: দ্বিবার্ষিক বিতরণের ক্ষেত্রে কীভাবে কুইসিবিনোমিয়াল পৃথক হয়। যখন প্রতিক্রিয়ার পরিবর্তনশীল একটি অনুপাত হয় (উদাহরণস্বরূপ মানগুলি 0.23, 0.11, 0.78, 0.98 অন্তর্ভুক্ত), একটি কাসিবিনোমিয়াল মডেল আরে চালিত হবে …

30 r  generalized-linear-model  binomial  overdispersion  quasi-likelihood 

আশা করি এটি এমন একটি প্রশ্নের উত্তর যা এখানে মিশ্রিত-ইফেক্ট মডেল lmer( lme4 আর প্যাকেজ থেকে) ফিট করে এমন স্কোয়ারের পরিমাণগুলি পচিয়ে দেওয়ার প্রকৃতি সম্পর্কে এখানে কেউ উত্তর দিতে পারে । প্রথমে আমার বলা উচিত যে আমি এই পদ্ধতির ব্যবহারের সাথে বিতর্ক সম্পর্কে সচেতন, এবং বাস্তবে আমি মডেলগুলির তুলনায় বুটস্ট্র্যাপড …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

আমি ভাবছিলাম যে এই দুটি ফাংশনের মধ্যে বর্তমান পার্থক্য সম্পর্কে কেউ আমাকে আলোকিত করতে পারে কিনা। আমি নিম্নলিখিত প্রশ্নটি পেয়েছি: মিশ্রিত প্রভাবগুলির মডেলগুলির জন্য কীভাবে এনএলএম বা lme4 আর লাইব্রেরি চয়ন করবেন? তবে কয়েক বছর আগের তারিখ। এটি সফ্টওয়্যার চেনাশোনাগুলিতে আজীবন। আমার নির্দিষ্ট প্রশ্নগুলি হ'ল: সেখানে (এখনো) কোনো পারস্পরিক সম্পর্ক …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

আমি বিস্মিত হই যে দ্বি-দ্বি বিতরণের তাত্পর্য "পরীক্ষা" করার জন্য কোনও পরিসংখ্যান পরীক্ষা আছে কিনা? মানে, আমার ডেটা বিমোডাল বিতরণে কতটা পূরণ করে বা না? যদি তা হয় তবে আর প্রোগ্রামে কোন পরীক্ষা আছে কি?

30 r  hypothesis-testing  distributions  bimodal 

আমার কাছে একটি বড় ডেটাসেট রয়েছে এবং আমি একটি মাত্রিক হ্রাস করতে চাই। এখন যেখানেই আমি পড়ি আমি এর জন্য পিসিএ ব্যবহার করতে পারি। যাইহোক, পিসিএ গণনা / সম্পাদন করার পরে আমি কী করব তা এখনও মনে হচ্ছে না। আর এ সহজেই কমান্ড দিয়ে সম্পন্ন হয় princomp। তবে পিসিএ গণনার …

30 r  pca 

আমি আর এবং পরিসংখ্যানগুলির সাথে খুব সাধারণভাবেই নতুন, তবে আমার একটি স্ক্র্যাপপ্লট তৈরি করা দরকার যা আমি মনে করি এটি তার স্থানীয় সামর্থ্যের বাইরে। আমার কাছে পর্যবেক্ষণগুলির বেশ কয়েকটি ভেক্টর রয়েছে এবং আমি তাদের সাথে একটি স্ক্র্যাপপ্লট তৈরি করতে চাই এবং প্রতিটি জুটি তিনটি বিভাগের মধ্যে একটিতে পড়ে। আমি একটি …

30 r  data-visualization  scatterplot